Buổi bốc thăm xếp lịch thi đấu Giải bóng đá nữ Cúp Quốc gia 2020 diễn ra vào ngày 17/6 tại Hà Nội. Ở lần thứ 2 giải nữ Cúp Quốc gia được tổ chức, có 7 đội bóng tham dự và được chia thành 2 bảng.